在蛋白质领域的研究中，分类数据库备受关注。其中，SCOP（Structural Classification of Proteins，蛋白质结构分类系统）是一种非常有价值的分类数据库，主要用于对已知蛋白质进行分类和命名。SCOP的诞生给研究者提供了一种归纳不同蛋白质结构的方法，其准确性和可靠性已经得到了广泛的认可。本文将着重介绍SCOP的分类方法、特点以及在蛋白质领域研究中的应用。
一、SCOP分类方法
SCOP分类系统主要从结构上对蛋白质进行分类，这是与其它分类系统的主要区别。SCOP分类结构涉及聚合基元、态形态等复杂的结构分析技术，同时也需要进行人工审核和整理。SCOP将蛋白质结构划分为四个层次：超家族、家族、蛋白质和Peptide，其中Peptide通常是一条蛋白质链中的片段。超家族是更大的分类单位，包含很多家族和单独蛋白质，而家族和单独蛋白质是更小的分类单位。
在进行结构分类时，SCOP的目标是要寻找结构上的同源性，也就是说，寻找拓扑相同的结构元素。为了实现这个目标，SCOP将同源性分为三个级别。之一级同源性包括由一组拓扑外形、序列含量、成分保守性等共同决定的同源蛋白；第二级中的蛋白具有共同原始构造的结构元素；第三级蛋白的结构特点则是单独的超微结构、折叠模模式或者是局限于某些构造特征。
二、SCOP特点
1. SCOP分类准确性高
由于结构上的同源性是蛋白质分类的主要依据，而拓扑外形、序列含量、成分保守性等共同决定的同源蛋白在SCOP系统中被放到了之一级，因此SCOP系统对蛋白质的分类具有很高的准确性。此外，SCOP通过一系列的分类标准，例如蛋白质的序列之间的同源性、蛋白质的折叠模式等，使得分类更加彻底。
2. SCOP具有良好的细节分类能力
不同于其它分类系统的是，SCOP分类系统非常注重细节分类的能力，这在一定程度上可以提高数据的可靠性和实用性。例如，所有的非蛋白质结构都被限制在其它分类系统中，确保了蛋白质结构的精准展示。
3. SCOP数据更新及时
SCOP系统自发布以来一直在不断地更新。基于新的序列和NMR结构的研究数据，SCOP数据库能够自动地对分类结果进行计算和更新。同时，SCOP的数据更新也非常及时，保证了其数据的可靠性。
三、SCOP在蛋白质领域的研究应用
SCOP作为一种可靠的分类系统，不仅在科技研究领域中具有非常重要的应用价值，同时也广泛应用于生物信息学分析。其主要应用分为以下几个方面：
1. SCOP在蛋白质结构预测和构建的应用
SCOP能够给出蛋白质结构以及其在分类系统中的结构位置，这使得SCOP广泛应用于蛋白质结构预测和构建中。在蛋白质结构预测中，通过将现有的氨基酸序列与SCOP分类系统中的同源蛋白对比，可以预测出其所属的结构类型，也可以进行蛋白质的模拟及其结构构建。
2. SCOP在蛋白质结构分析中的应用
通过对SCOP数据库中的分类系统以及其中蛋白质的折叠模式的研究，能够加深对蛋白质结构的理解。通过比较分类系统之间的数据，能够找出不同折叠模型之间的关系，从而发现新的折叠模型，包括未分类和尚未知道的折叠模型等。
3. SCOP在蛋白质工程中的应用
SCOP作为一种可靠的分类系统在蛋白质工程领域中也应用广泛。通过在SCOP分类系统中寻找特定结构类型的蛋白质，可以快速找到需要的目标蛋白质，并进行研究和处理。
四、结论
作为一种高度可靠的蛋白质分类数据库，SCOP在蛋白质领域的研究领域应用广泛，其分类准确性高，有良好的细节分类能力，数据更新也非常及时。在今后的蛋白质领域研究中，SCOP的使用将会更加广泛，能够精准的描述和解决蛋白质研究中的问题。
相关问题拓展阅读：
oracle里，scope=both或者scop=pfile这个选项是做什么用的？谢谢你。
应该袭腔是scope=both和scope=spfile
Oracle 里面有个叫做spfile的东西，就是动态参数文件，里面设置了Oracle 的各种参数。所谓的动态，就是说你可以在不关闭数据库的情况下，更改数据库参数，记录在spfile里面。更改参数的时候，有4种盯裂scope选项。scope就是范围
++ scope=spfile 仅仅更改spfile里面的记载，不更改内存，也就是不立即生效，而是等下次数据库启动生效。有一些参数只允许用这种方法更改
++ scope=memory 仅仅更改内存，不改spfile。也就是下次启动就失拍则衫效了
++ scope=both 内存和spfile都更改
++ 不指定scope参数，等同于scope=both.
关于scop分类数据库的介绍到此就结束了，不知道你从中找到你需要的信息了吗 ？如果你还想了解更多这方面的信息，记得收藏关注本站。
香港服务器首选树叶云，2H2G首月10元开通。树叶云（www.IDC.Net）提供简单好用，价格厚道的香港/美国云 服务器 和独立服务器。IDC+ISP+ICP资质。ARIN和APNIC会员。成熟技术团队15年行业经验。
null这是什么意思
null美 [nʌl]英 [nʌl]adj.没有价值的；无用的；【法】无法律效力的；【科技】没有n.【数】数字零；【计】空位；空白符号；【电子】无信号v.抵消；〈罕〉【法】宣布无效；〈罕〉彻底消灭空值；空字符；空指针复数：nulls过去式：nulled现在分词：nulling
国家计算机二级access上机考试怎么考，考哪些内容？
考纲如下： 全国计算机等级考试二级ACCESS考试大纲 二级（Access数据库程序设计）考试大纲 公共基础知识 基本要求 1. 掌握算法的基本概念。 2. 掌握基本数据结构及其操作。 3. 掌握基本排序和查找算法。 4. 掌握逐步求精的结构化程序设计方法。 5. 掌握软件工程的基本方法，具有初步应用相关技术进行软件开发的能力。 6. 掌握数据库的基本知识，了解关系数据库的设计。 考试内容 一、基本数据结构与算法 1. 算法的基本概念；算法复杂度的概念和意义（时间复杂度与空间复杂度）。 2. 数据结构的定义；数据的逻辑结构与存储结构；数据结构的图形表示；线性结构与非线性结构的概念。 3. 线性表的定义；线性表的顺序存储结构及其插入与删除运算。 4. 栈和队列的定义；栈和队列的顺序存储结构及其基本运算。 5. 线性单链表、双向链表与循环链表的结构及其基本运算。 6. 树的基本概念；二叉树的定义及其存储结构；二叉树的前序、中序和后序遍历。 7. 顺序查找与二分法查找算法；基本排序算法（交换类排序，选择类排序，插入类排序）。 二、程序设计基础 1. 程序设计方法与风格。 2. 结构化程序设计。 3. 面向对象的程序设计方法，对象，方法，属性及继承与多态性。 三、软件工程基础 1. 软件工程基本概念，软件生命周期概念，软件工具与软件开发环境。 2. 结构化分析方法，数据流图，数据字典，软件需求规格说明书。 3. 结构化设计方法，总体设计与详细设计。 4. 软件测试的方法，白盒测试与黑盒测试，测试用例设计，软件测试的实施，单元测试、集成测试和系统测试。 5. 程序的调试，静态调试与动态调试。 四、数据库设计基础 1. 数据库的基本概念：数据库，数据库管理系统，数据库系统。 2. 数据模型，实体联系模型及E-R图，从E-R图导出关系数据模型。 3. 关系代数运算，包括集合运算及选择、投影、连接运算，数据库规范化理论。 4. 数据库设计方法和步骤：需求分析、概念设计、逻辑设计和物理设计的相关策略。 考试方式 1. 公共基础知识的考试方式为笔试，与Access数据库程序设计的笔试部分合为一张试卷。 公共基础知识部分占全卷的30分。 2. 公共基础知识有10道选择题和5道填空题。 Access数据库程序设计 基本要求 1. 具有数据库系统的基础知识。 2. 基本了解面向对象的概念。 3. 掌握关系数据库的基本原理。 4. 掌握数据库程序设计方法。 5. 能使用Access建立一个小型数据库应用系统。 考试内容 一、 数据库基础知识 1. 基本概念： 数据库，数据模型，数据库管理系统，类和对象，事件。 2. 关系数据库基本概念： 关系模型（实体的完整性，参照的完整性，用户定义的完整性），关系模式，关系，元组，属性，字段，域，值，主关键字等。 3. 关系运算基本概念： 选择运算，投影运算，连接运算。 4. SQL基本命令： 查询命令，操作命令。 5. Access系统简介： （1）Access系统的基本特点。 （2）基本对象：表，查询，窗体，报表，页，宏，模块。 二、数据库和表的基本操作 1. 创建数据库： （1）创建空数据库。 （2）使用向导创建数据库。 2. 表的建立： （1）建立表结构：使用向导，使用表设计器，使用数据表。 （2）设置字段属性。 （3）输入数据：直接输入数据，获取外部数据。 3. 表间关系的建立与修改： （1）表间关系的概念：一对一，一对多。 （2）建立表间关系。 （3）设置参照完整性。 4. 表的维护： （1）修改表结构：添加字段，修改字段，删除字段，重新设置主关键字。 （2）编辑表内容：添加记录，修改记录，删除记录，复制记录。 （3）调整表外观。 5. 表的其他操作： （1）查找数据。 （2）替换数据。 （3）排序记录。 （4）筛选记录。 三、查询的基本操作 1. 查询分类： （1）选择查询。 （2）参数查询。 （3）交叉表查询。 （4）操作查询。 （5）SQL查询。 2. 查询准则： （1）运算符。 （2）函数。 （3）表达式。 3. 创建查询： （1）使用向导创建查询。 （2）使用设计器创建查询。 （3）在查询中计算。 4. 操作已创建的查询： （1）运行已创建的查询。 （2）编辑查询中的字段。 （3）编辑查询中的数据源。 （4）排序查询的结果。 四、窗体的基本操作 1. 窗体分类： （1）纵栏式窗体。 （2）表格式窗体。 （3）主/子窗体。 （4）数据表窗体。 （5）图表窗体。 （6）数据透视表窗体。 2. 创建窗体： （1）使用向导创建窗体。 （2）使用设计器创建窗体：控件的含义及种类，在窗体中添加和修改控件，设置控件的常见属性。 五、报表的基本操作 1. 报表分类： （1）纵栏式报表； （2）表格式报表。 （3）图表报表。 （4）标签报表。 2. 使用向导创建报表。 3. 使用设计器编辑报表。 4. 在报表中计算和汇总。 六、页的基本操作 1. 数据访问页的概念。 2. 创建数据访问页： （1）自动创建数据访问页。 （2）使用向导数据访问页。 七、宏 1. 宏的基本概念。 2. 宏的基本操作： （1）创建宏：创建一个宏，创建宏组。 （2）运行宏。 （3）在宏中使用条件。 （4）设置宏操作参数。 （5）常用的宏操作。 八、模块 1. 模块的基本概念： （1）类模块。 （2）标准模块。 （3）将宏转换为模块。 2. 创建模块： （1）创建VBA模块：在模块中加入过程，在模块中执行宏。 （2）编写事件过程：键盘事件，鼠标事件，窗口事件，操作事件和其他事件。 3. 调用和参数传递。 4. VBA程序设计基础： （1）面向对象程序设计的基本概念。 （2）VBA编程环境：进入VBE，VBE界面。 （3）VBA编程基础：常量，变量，表达式。 （4）VBA程序流程控制：顺序控制，选择控制，循环控制。 （5）VBA程序的调试：设置断点，单步跟踪，设置监视点。 考试方式 1. 笔试：90分钟，满分100分，其中含公共基础知识部分的30分。 2. 上机操作：90分钟，满分100分。 上机操作包括： （1）基本操作。 （2）简单应用。 （3）综合应用。 这里有模拟题1：指定教材：全国计算机等级考试二级教程—Access数据库程序设计 高等教育出版社 2：大纲：3：历年真题：4：模拟题：5;上机注意事项以及辅导：*********** 补充： 那就上书店买两本辅导才料吧，那个效果来的快。 *********** --- 以上，希望对你有所帮助。
可以通过to_date方式实现。 sql：select to_date(2015-07-05 10:30:40,YYYY-MM-DD HH24:MI:SS) from dual ;备注：后面的是日期的显示类型，前面的是符合时间定于规则的字符串。 此时生成的就是日期类型。
发表评论