这个文件在数据处理与可视化中扮演了什么角色-探索chartdata.js (这个文件夹)

教程大全 2025-07-15 00:14:30 浏览次

ChartData.js 是一个用于创建各种类型图表的 JavaScript 库，它支持多种图表类型，包括折线图、柱状图、饼图等，并且提供了丰富的配置选项和交互功能。

成吉思汗战士怎么出装备

40国传推荐6星宝石全2孔12防其余什么力量石头可以只洗到28因为国传是过度装备很快就能换成神传了没有必要搞的太好

50还是国传

60及以上神传推荐7星武器60的石头3孔该打防石头的打防石头该是暴击的就打暴击灵魂洗紫铭刻麻将PS(麻将最好是远攻跟魔攻减伤)

以上装备看个人能力一般的玩家只要每天刷J 征税然后再进个卫队的应该做完也不需要花多少钱

60以后就是准备慢慢的存钱搞天传

如何用Python绘制Circos图

用Python实现Circos图的绘制在线绘制的Circos有一定局限性，如对数据的要求、个性化的局限和处理速度等的问题，但如果你是一个Pythoneer或者喜欢用更加Pythonic的方式来个性化地绘制Circos图，那么今天就跟随我一起用代码实现这一目标吧！安装Circos包首先，登录Python的包索引网站PythonpackageIndex（PyPI，正确读音是：PiePeeAi），找到Circos包的下载页：该包/模块的作者是我的好友EricMa。你可以选择下载wheeler文件，然后本地安装。也可以在Shell下直接通过pip进行安装：pipinstallcircos注意，所支持的Python版本必须是3.x，对2不支持。选择数据当安装了circos包后，我们就可以直接应用这个包来写代码了。为了演示方便，我需要应用一些数据。作为内科医师，就让我来展示一下老本行：处理药物与肝酶细胞色素P450的相互关系的可视化。由于是为了抛砖引玉，所以绘制出的Circos图相对简单。我们先从美国FDA官网下载不同细胞色素相关的各种口服药物表。共202种常用的口服药物，涵盖内科学、肿瘤学、神经科和心理学等学科。数据文件如下：可以看到这个数据的结构：是按肝细胞色素酶进行分类，共分8个列。这8个细胞色素酶分别是：CYP1A2,CYP2B6,CYP2C8,CYP2C9,CYP2C19,CYP2D6,CYP2E1和CYP3A4。我们将要建立各个口服药与这些肝酶之间关系的Circos图，从而了解通过相同肝酶代谢或转化的药物之间是否存在相互作用。导入各个模块和读入数据导入各个模块：fromcircosimportCircosPlotimportxlrdimportPandasaspdimportnumpyasnp读入文件：filename=.\\=_workbook(filename)print(Fileloaded!)提取数据：nrows=_by_name(Sheet1)=_by_name(Sheet1)_values(0)data=[_by_name(Sheet1)_values(i)foriinrange(1,nrows)]df=(data,columns=header)df[df==]=读取后，药物和酶的数据为pandas的DataFrame数据结构，细胞色素P450酶的名字为columns的名字。我们可以检查一下数据：修数据，尤其是处理NA数据df_dict={}foriinrange(len()):df_dict[(i)]=list((i)())节点和连线创建节点（nodes）数据，在我这个例子里就是各个药物和肝酶：nodes=[]forkeYindf_()(df_dict[key])nodes=list(nodes)headers=list()enzymes=[0]*(header)([0]*5)(enzymes)创建连线（edges）数据，我们应用tuple（元组）这个数据结构来表示药物与特定肝酶之间的关系：edges_origin=[]forkeyindf_():forvalueindf_dict[key]:edges_((key,value))绘图绘制Circos图：c=CircosPlot(nodes,edges_origin,radius=10,nodecolor=blue,edgecolor=red,)()得到了下面这张所有药物与肝酶之间的图：左上方是8个肝脏细胞色素P450酶（CYP1A2、CYP2B6、CYP2C8、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1和CYP3A4）。其它点即为202种口服药物。每种药物都与参与代谢和转化它的P450酶相连。与相同酶连接的不同药物，理论上应该都存在相互作用，但具体如何还要看与酶的作用机理。个性化绘图如果我们打算分别可视化出不同肝酶的关系图形，我们只需改变连线信息，即edges信息：edges=[]‍forvalueindf_dict[CYP2B6]((CYP2B6,value))c=CircosPlot(nodes,edges,radius=10,nodecolor=orange,edgecolor=orange,)()从而我们得到了各种肝酶所代谢和转化药物的图形用PS将它们合并：相同肝酶所代谢和转化的药物用相同颜色的edges表示。显示特定药物最后，我们可以挑选其中一些感兴趣的药物来进行观察，例如，我从这202个药物中指定几个我感兴趣的药物：propafenone（心律平）,acetaminophen（对乙酰氨基酚）,paclitaxel（紫杉醇）,ibuprofen（布洛芬）,Losartan（洛沙坦）,omeprazole（奥美拉唑）,carvediolo（卡维地洛）,codeine（可待因）,theophylline（茶碱）,quinidine（奎尼丁）,verapamil（异搏定）,lovastatin（洛伐他汀）,nitrendipine（尼群地平）然后重新建立edges：medications=[propafenone,acetaminophen,paclitaxel,ibuprofen,losartan,omeprazole,carvedilol,codeine,theophylline,quinidine,verapamil,lovastatin,nitrendipine]edges_candidate=set()formedicationinmedications:foredgeinedges_origin:ifmedication==edge[1]:edges_(edge)edges_candidate=list(edges_candidate)然后再绘图：c=CircosPlot(nodes,edges_candidate,radius=10,nodecolor=black,edgecolor=black,)()从而得到这张图。