如何在Linux上安装EMBOSS-linux安装emboss (如何在linux系统添加奔图打印机)

教程大全 2025-07-17 15:22:11 浏览次

EMBOSS是一款用于生物信息学数据分析的免费软件包，它具有强大的特性和功能，能够帮助生物信息学家进行多样的数据分析。在这篇文章中，我们将介绍如何在Linux上安装EMBOSS。

步骤1：下载EMBOSS

我们需要在EMBOSS官方网站上下载软件包，网址为。在网站的左侧侧边栏中，可以看到“Download”和“Tarball”两个链接。我们需要点击“Tarball”链接，下载最新版本的EMBOSS安装包。

步骤2：安装依赖项

在安装EMBOSS之前，我们必须先安装一些必要的依赖库和工具。具体而言，我们需要安装以下软件包：

– GCC编译器

– GNU Automake

– GNU Autoconf

– Zlib开发库

我们可以使用每个Linux发行版的软件包管理器来安装这些软件包。比如，在Ubuntu上，我们可以使用以下命令来安装这些软件包：

sudo apt-get install gcc automake autoconf zlib1g-dev

步骤3：解压缩EMBOSS安装包

我们需要将下载的EMBOSS安装包解压缩到一个目录中。在终端中切换到下载的EMBOSS安装包所在的目录，然后使用以下命令来解压缩：

tar -xvf emboss-latest.tar.gz

这将在当前目录下创建一个名为“emboss-X.X.X”（其中“X.X.X”代表EMBOSS的版本号）的新目录，里面包含了EMBOSS的源代码。

步骤4：编译和安装EMBOSS

现在，我们需要切换到刚刚解压缩的EMBOSS目录，并开始编译和安装。在终端中输入以下命令：

cd emboss-X.X.X

./configure –prefix=/usr/local/emboss

sudo make install

这几个命令将会：

– 进入到EMBOSS目录

– 配置安装选项

– 编译软件包

– 安装软件包

上述第3步和第4步需要一段时间才能完成，具体时间取决于你的电脑处理器性能和内存大小。

步骤5：测试EMBOSS

现在，EMBOSS已经安装完毕，我们可以通过运行以下命令来测试它：

which emboss

如果输出如下，则说明EMBOSS已经成功安装：

/usr/local/emboss/bin/emboss

步骤6：使用EMBOSS

EMBOSS安装完毕后，我们可以通过终端或调用脚本等方式进行操作。例如，你可以使用以下命令来查看EMBOSS的版本号：

embossversion

更多的EMBOSS使用方式和命令，请访问官方文档网站。

在Linux上安装EMBOSS是一项容易的任务，只需要遵循上述步骤，就可以轻松地安装它。EMBOSS是一款强大的生物信息学数据分析软件，它的安装可以帮助我们更好地处理生物信息学数据。

相关问题拓展阅读：

求助，我在安装EMBOSS遇到问题

在程序管理里面可以查看到是否有安装支付宝的安全控件如果它已经提示你了，就代表你已经安装过你使用IE浏览器来购买东西即可

请教个emerge失败的问题

昨天升级时发现n个包都报同一个错误：

libtool: compile: Failed to create `.libs’

make: Error 1

make:Waiting For unfinished jobs….

libtool: compile: Failed to create `.libs’

make: Error 1

libtool: compile: Failed to create `.libs’

make: Error 1

make: Leaving directory `/var/tmp/portage/app-text/poppler-0.10.4/work/poppler-0.10.4/goo’

make: Error 1

make: Leaving directory `/var/tmp/portage/app-text/poppler-0.10.4/work/poppler-0.10.4′

make: Error 2

看了看，我猜测可能是libtool有问题，于是打算从新emerge一下libtool，但是发现它也报错

Assembler messages:

Fatal error: can’t create libltdl/.libs/libltdl_libltdl_la-lt__alloc.o: No such file or directory

make: Error 1

make:Waiting for unfinished jobs….

Assembler messages:

Fatal error: can’t create libltdl/.libs/libltdl_libltdl_la-lt_dlloader.o: No such file or directory

Assembler messages:

Fatal error: can’t create libltdl/loaders/.libs/libltdl_libltdl_la-preopen.o: No such file or directory

然后想也不想的就要从新emerge gcc。。。没想到它更离谱，报如下错误：

configure: creating ./config.status

mkdir: cannot create directory `conf4892.dir’: File exists

config.status: creating Makefile

config.status: creating mkheaders.almost

config.status: creating config.h

make: Leaving directory `/var/tmp/portage/sys-devel/gcc-4.3.3/work/build’

make: Error 2

make: Leaving directory `/var/tmp/portage/sys-devel/gcc-4.3.3/work/build’

make: Error 2

我找到这个文件，删除了。从新emerge又报了一个类似的错误。删除所有临时文件，又从新下载了gcc的包，后还是不能解决。

我的emerge －－info如下：

Portage 2.1.6.7 (hardened/linux/amd64/2023.0/desktop, gcc-4.3.3, glibc-2.9_pr1, 2.6.28-gentoo-r2 x86_64)

System uname:

Timestamp of tree: Thu, 26 Feb:35:01 +0000

ccache version 2.4

app-shells/bash: 3.2_p48-r1

dev-lang/python: 2.5.4-r2

dev-util/ccache: 2.4-r8

dev-util/cmake: 2.6.2

sys-apps/baselayout: 2.0.0

sys-apps/openrc: 0.4.3-r1

sys-apps/sandbox: 1.3.8

sys-devel/autoconf: 2.13, 2.63

sys-devel/automake: 1.5, 1.7.9-r1, 1.9.6-r2, 1.10.2

sys-devel/binutils: 2.19.1

sys-devel/gcc-config: 1.4.1

sys-devel/libtool: 2.2.6a

virtual/os-headers: 2.6.28-r1

ACCEPT_KEYWORDS=”amd64 ~amd64″

CBUILD=”x86_64-pc-linux-gnu”

CFLAGS=”-march=core2 -O2 -pipe -fforce-addr”

CHOST=”x86_64-pc-linux-gnu”

CONFIG_PROTECT=”/etc”

CONFIG_PROTECT_MASK=”/etc/ca-certificates.conf /etc/env.d /etc/fonts/fonts.conf /etc/gconf /etc/gentoo-release /etc/revdep-rebuild /etc/sandbox.d /etc/terminfo /etc/udev/rules.d”

CXXFLAGS=””

DISTDIR=”/usr/portage/distfiles”

EMERGE_DEFAULT_OPTS=” –keep-going”

FEATURES=”ccache distlocks fixpackages keepwork parallel-fetch protect-owned sandbox sfperms strict unmerge-orphans userfetch”

GENTOO_MIRRORS=”

LANG=”zh_CN.UTF-8″

LDFLAGS=”-Wl,-O1″

MAKEOPTS=”-j3″

PKGDIR=”/usr/portage/packages”

PORTAGE_RSYNC_OPTS=”–recursive –links –safe-links –perms –times –compress –force –whole-file –delete –stats –timeout=180 –exclude=/distfiles –exclude=/local –exclude=/packages”

PORTAGE_TMPDIR=”/var/tmp”

PORTDIR=”/usr/portage”

PORTDIR_OVERLAY=”/usr/local/portage/layman/gentoo-china”

USE=”X a52 aac aalib acl acpi alsa amd64 apm audiofile bash-completion berkdb bluetooth branding bzip2 cairo cddb cdparanoia cdr cjk cli cracklib crypt css dbus dri dts dv dvd dvdr dvdread eds emboss encode esd evo exif fam fbsplash ffmpeg firefox flac gdbm gif glade gpm gstreamer gtk hal hardened iconv immqt-bc isdnlog jpeg justify lame laptop ldap libnotify live mad midi mikmod mmx mng mp3 mpeg mudflap multilib ncurses nptl nptlonly ogg openal openexr opengl openmp pam pcre pdf perl pic png ppds pppd python qt3support quicktime readline reflection samba sdl session spell spl sse sse2 sse3 ssl startup-notification subversion svg symlink Sysfs tcpd theora tiff truetype unicode urandom u v4l v4l2 vcd vim-syntax vorbis wifi wma wmf x264 xml xorg xpm xscreensaver xulrunner xv xvid xvmc zlib” ALSA_CARDS=”ali5451 als4000 atiixp atiixp-modem bt87x ca0106 cmipci emu10k1x ens1370 ens1371 es1938 es1968 fm801 hda-intel intel8x0 intel8x0m maestro3 trident u-audio via82xx via82xx-modem ymfpci” ALSA_PCM_PLUGINS=”adpcm alaw asym copy dmix dshare dsnoop empty extplug file hooks iec958 ioplug ladspa lfloat linear meter mmap_emul mulaw multi null plug rate route share shm softvol” APACHE2_MODULES=”actions alias auth_basic authn_alias authn_anon authn_dbm authn_default authn_file authz_dbm authz_default authz_groupfile authz_host authz_owner authz_user autoindex cache dav dav_fs dav_lock deflate dir disk_cache env expires ext_filter file_cache filter headers include info log_config logio mem_cache mime mime_magic negotiation rewrite setenvif speling status unique_id userdir usertrack vhost_alias” ELIBC=”glibc” INPUT_DEVICES=”keyboard mouse synaptics evdev” KERNEL=”linux” LCD_DEVICES=”bayrad cfontz cfontz633 glk hd44780 lb216 lcdm001 mtxorb ncurses text” USERLAND=”GNU” VIDEO_CARDS=”radeon”

Unset: CPPFLAGS, CTARGET, FFLAGS, INSTALL_MASK, LC_ALL, LINGUAS, PORTAGE_COMPRESS, PORTAGE_COMPRESS_FLAGS, PORTAGE_RSYNC_EXTRA_OPTS

关于linux安装emboss的介绍到此就结束了，不知道你从中找到你需要的信息了吗？如果你还想了解更多这方面的信息，记得收藏关注本站。

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Linux系统怎么安装？

Linux安装前的准备工作1．用Windows系统收集硬件信息在安装Linux之前，您需要借助Windows系统了解计算机硬件的基本信息，如内存大小、声卡、显示器、鼠标和显卡型号等。 2．设置从光盘引导系统Linux支持几种安装方式，但直接以光盘开机启动进行安装最方便和快速。若要机器以光盘启动，需要修改BIOS的设置，将CD-ROM变更至开机顺序的第一位。 3．Linux分区Linux分区的表示方法分区就是将磁盘驱动器分隔成独立的区域，每个区域都如同一个单独的磁盘驱动器，在DOS/Windows系统下磁盘分区可分为C、 D和E盘等。但Linux则将磁盘视为块设备文件来管理使用，它以 /dev（device的缩写）开头表示。例：在Linux用 “/dev/hda1”表示Windows下的C盘其中：hd 表示IDE硬盘（SCSI硬盘用sd）；hda 为第一个IDE 硬盘（第二为 hdb）；/dev/hda1 为主分区，逻辑分区从5 开始，如： /dev/hda5、/dev/hda6、/dev/hda7等。为Linux准备分区Linux分区和Windows分区不同，不能共用。所以需要为Linux单独开辟一个空闲的分区，最好是最后一个分区。如图1中利用Windows下的Partition Magic（分区魔法）软件，在D盘上腾出空间创建新分区E盘（或利用已有的空闲E盘），文件类型暂设为FAT32，作为稍后创建Linux分区使用，RedHat 9.0 大约需4 ～ 5GB的空间。 4．Linux 的文件系统对于不同的操作系统，文件系统也不同。 Windows文件系统为FAT16、FAT32和NTFS。而Linux的文件系统可分为ext2、ext3、swap和vfat。 ext2支持最多为255 个字符的文件名；ext3 是基于 ext2之上，主要优点是减少系统崩溃后恢复文件系统所花费的时间，RedHat 9.0 默认文件系统为ext3；交换区swap是被用于支持虚拟内存；Windows的FAT分区在Linux下显示为vfat文件类型。 1．用RedHat 9.0第一张安装光盘引导开机，系统在开机后会出现安装菜单。安装菜单中提供了供用户选择的图形和文本模式的安装方式，按回车选择图形模式进行安装。在进入图形画面的安装模式前，RedHat 9.0比以往的版本多了一个环节，那就是提示对安装光盘介质进行检测，也可按“Skip”按钮跳过检测。 2．接着安装程序会自动检测硬件，包括视频卡（显示卡）、显示器和鼠标的配置，然后进入图形画面的安装向导。在出现“语言选择”的画面中，我们选择“简体中文”，这样接下去的安装过程界面的文字都会改为中文。在“键盘配置”画面中接受默认的“美国英语式”键盘。选择“下一步”，在“鼠标配置”窗口，系统自动检测出鼠标的配置。 3．选择安装类型，安装类型包含四种不同的安装方式：个人桌面、工作站、服务器和定制。 “服务器”的安装适用于专职的服务器使用，“个人桌面”和“工作站”适合于初学者，为了让你更多地了解安装过程，我们将选择“定制”类型进行安装。 4．磁盘分区设置：确认了“定制”方式之后，系统会出现“磁盘分区设置”窗口，它提供了两种分区方式：“自动分区”和“用Disk Druid手工分区”。

如何在Linux系统下安装软件？

在windows下安装软件大家都觉得很容易，只要双击setup或是install的图标，然后跟着向导一步一步的按提示做就可以了，但是在linux下安装软件就不像windows下那样容易了，有时你找到的是没有编译过的软件源码，那就更加的麻烦了，这里就介绍一下如何安装linux的软件啦！linux下的软件一般都是经过压缩的，主要的格式有这几种：rpm、tar、、tgz等。所以首先拿到软件后第一件事就是解压缩。一、在xwindow下以rpm格式的软件安装比较容易，只要在把鼠标移到文件上单击右键，在弹出的菜单里会有专门的三项（只有在右键单击rpm文件才会出现）show info，upgrade和install，这三项的意思大家都很清楚了，我就不多说了。 rpm格式说了，接着就是tar，，tgz等，在xwindow下双击这些格式的文件就会自动解压缩的，是解压缩而不是像rpm那样有install选项的，install文件会在你解压缩后才出现，不过这里我要先说一下，在你双击install前建议先好好看一下readme，因为你所要安装这些软件可能是没有编译的，所以看一下会比较好。二、说完了xwindow下的安装和解压缩，接着说在文本模式下如何解压缩和安装，还有编译源码了。首先说rpm的，以root身份登陆后（用其他的身份登陆也可以但有些软件就不能被安装）键入rpm －i你所要解压缩的文件＋扩展名（当然是rpm）也不是很难吧，这里我要说的是“－i”意思是install，如果你想要卸载或是要执行其他的指令就打rpm －－help，看电脑给你的提示吧，为了照顾那些E文不太好的人我这里就写几个常用的参数：－e：卸载相关的应用程序，－U（注意是大写）：升级软件包，－pql：列出rpm软件包的相关信息，－qf：查找指定文件属于哪个软件包。至于那些其他格式的软件则可以用gunzip，gzip，tar和unzip等指令来解压缩，然后再运行install。通过解包后会得到一些文件，然后进入刚才解压缩后文件目录用“ls －F －color”指令看一下所得到的文件，一般有两种情况：第一种是文件为已经编译好的程序（无须再编译了）用上面的察看文件命令会以带“＊”标记的亮绿色显示；第二种则是需要由你自己编译的源代码。得到的是源代码的话，就需要我们自己编译来得到可运行的程序。编译源代码听到编译是不是就吓到你了呢，其实说穿了也就加上几句话而已，对初学者是有些困难想用好的操作系统就需要学习嘛，等你学会了在MM前露一手的时候想想吧……，在编译之前先要认真的阅读一下readme文档，老鸟们就不需要了吧，等你阅读完了以后就执行./configuremakemake install（只有Root身份才能执行此命令），编译完成之后便会在当前目录或src子目录下得到软件的可执行程序。介绍完了，大家是不是觉的RPM的软件安装比较容易一点呢，但我个人意见初学者还是多选择RPM格式以外的软件，因为通过编译软件的源码可以为你以后编译内核打下一定的基础。